Là một trong những nghệ sĩ Việt Nam đầu tiên tạo được tiếng vang quốc tế trong những năm 1990, với các trình diễn đặt câu hỏi về giới hạn của tiếng nói cá nhân trong xã hội, Bùi Công Khánh còn sử dụng nhiều chất liệu khác trong thực hành của mình, như: tranh vẽ, điêu khắc, sắp đặt, phim, và phác thảo. Mang tính thách thức, đồng thời nên thơ, nghệ thuật của anh ngày một phát triển bề dày và chiều sâu, thể hiện thái độ nghiêm túc với nghiên cứu lịch sử, cùng sự kết hợp nhuần nhuyễn giữa đào tạo mỹ thuật truyền thống và phương pháp/thực hành nghệ thuật có tính biện luận, vị niệm. Các tác phẩm của Khánh đã được triển lãm rộng rãi tại Đông Nam Á và trên thế giới. Các dự án gần đây của anh bao gồm: ‘An Atlas of Mirrors – Singapore Biennale 2016’, Bảo tàng Nghệ thuật Singapore, Singapore, 2016; ‘Lạc Chốn’ (triển lãm cá nhân), Sàn Art và The Factory, TP. Hồ Chí Minh, 2016; ‘Fortress Temple’ (triển lãm cá nhân), 10 Chancery Lane Gallery, Hong Kong, 2015; ‘Mắt Quay: Nghệ thuật từ Đông Nam Á’, Arter, Istanbul, 2014; ‘Concept, Context, Contestation: Art and the Collective in South East Asia’, BACC, Bangkok (triển lãm lưu động), 2013-2015; 6th Asia Pacific Triennial of Contemporary Art, Queensland Gallery of Modern Art, Brisbane, 2009.